Das Logo hat einen herzförmigen Umriss. Sein oberer Teil zeichnet in dunkelblauer Farbe die Silhouette des Isthmus von Panama nach. Außerdem ist auf den ersten Blick das rote Pilgerkreuz zu erkennen.
Wer genau hinschaut, sieht auch die Silhouette der Jungfrau Maria. Die fünf weißen Punkte darüber stellen ihre Krone dar und stehen gleichzeitig für die fünf Kontinente, aus denen die Pilgerinnen und Pilger kommen. Auch der dunkelblaue Schleier von Maria hat noch eine Bedeutung: Für sich betrachtet ist er dem berühmten Panama-Kanal nachempfunden.
Erzbischof José Domingo Ulloa Mendieta hat das Logo vorgestellt und dabei betont, dass dieses Logo dazu anregen soll, Maria als Brücke zu Jesus zu verstehen. Getreu dem Motto: Siehe, ich bin die Magd des Herrn; mir geschehe, wie du es gesagt hast. (Lk 1,38)